Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp49Q6P9L4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp49Q6P9L4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp49Q6P9L4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp49Q6P9L4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp49Q6P9L4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp49Q6P9L4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp49Q6P9L4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp49Q6P9L4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms