Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cdk13Q69ZA1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk13Q69ZA1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms