Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna3Q65CL1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms