Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Hoxa13Q62424 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Hoxa13Q62424 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Hoxa13Q62424 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Hoxa13Q62424 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa13Q62424 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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