Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ss18Q62280 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ss18Q62280 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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