Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd180Q62192 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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