Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3cQ62181 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms