Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sema4aQ62178 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema4aQ62178 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema4aQ62178 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema4aQ62178 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema4aQ62178 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema4aQ62178 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema4aQ62178 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema4aQ62178 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sema4aQ62178 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms