Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itga6Q61739 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms