Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trim25Q61510 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trim25Q61510 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trim25Q61510 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Trim25Q61510 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trim25Q61510 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trim25Q61510 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim25Q61510 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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