Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msi1Q61474 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Msi1Q61474 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Msi1Q61474 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms