Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Cd53Q61451 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cd53Q61451 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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