Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf3Q60980 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Klf3Q60980 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms