Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbbp4Q60972 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms