Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Grik1Q60934 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Grik1Q60934 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Grik1Q60934 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Grik1Q60934 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Grik1Q60934 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Grik1Q60934 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Grik1Q60934 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Grik1Q60934 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Grik1Q60934 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Grik1Q60934 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Grik1Q60934 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Grik1Q60934 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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