Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm1Q60636 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms