Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CttnQ60598 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CttnQ60598 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CttnQ60598 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms