Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Med13Q5SWW4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Med13Q5SWW4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms