Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim58Q5NCC9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim58Q5NCC9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms