Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp28Q5I043 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp28Q5I043 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp28Q5I043 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp28Q5I043 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Usp28Q5I043 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp28Q5I043 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp28Q5I043 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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