Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc47Q505F5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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