Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srek1ip1Q4V9W2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srek1ip1Q4V9W2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Srek1ip1Q4V9W2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Srek1ip1Q4V9W2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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