Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syne3Q4FZC9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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