Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms