Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc114Q3UX62 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms