Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms