Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx27Q3UHD6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms