Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip13Q3UA06 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms