Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmtk2Q3TYD6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmtk2Q3TYD6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms