Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc136Q3TVA9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms