Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms