Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zbtb38Q3LR78 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zbtb38Q3LR78 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zbtb38Q3LR78 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb38Q3LR78 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms