Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cpne9Q1RLL3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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