Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fgfbp3Q1HCM0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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