Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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ptchd1Q14B62 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ptchd1Q14B62 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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