Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ttc39dQ0VF76 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ttc39dQ0VF76 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Ttc39dQ0VF76 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Ttc39dQ0VF76 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ttc39dQ0VF76 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ttc39dQ0VF76 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ttc39dQ0VF76 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ttc39dQ0VF76 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc39dQ0VF76 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ttc39dQ0VF76 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ttc39dQ0VF76 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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