Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmntd2Q0VET5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmntd2Q0VET5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms