Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cntnap5bQ0V8T8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cntnap5bQ0V8T8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cntnap5bQ0V8T8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cntnap5bQ0V8T8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cntnap5bQ0V8T8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms