Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cnnm1Q0GA42 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms