Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pou6f1Q07916 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms