Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MestQ07646 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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MestQ07646 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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MestQ07646 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MestQ07646 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
MestQ07646 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms