Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms