Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms