Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sdr16c6Q05A13 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms