Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox12Q04890 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms