Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sox10Q04888 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sox10Q04888 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms