Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr5Q04683 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms