Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smpd1Q04519 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms