Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Crisp3Q03402 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms