Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax5Q02650 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms